Milanoviqi është në mosmarrëveshje të ashpra me kryeministrin kroat Andrej Plenkoviq për atë nëse duhet të mbështeten aplikimet e Suedisë dhe Finlandës në NATO, por dukë përfshirë këtu edhe një numër çështjesh tjera.
Milanoviqi dëshiron një ndryshim të ligjit zgjedhor të Bosnjës fqinje që do ta bënte më të lehtë për kroatët e Bosnjës zgjedhjen e përfaqësuesve të tyre në poste drejtuese para se Parlamenti kroat të ratifikojë anëtarësimin në NATO të dy shteteve.